EM菌在水产养殖中的使用效果被广泛认可 。但是EM菌发酵好的原液使用起来成本较高，而且经过厂家经销商长时间储存，菌的活力也会下降 。近几年市场上比较受到养殖户欢迎的是EM菌菌种 。养殖户购买回去后可以自己扩培 。自己发酵的EM菌菌液使用起来成本低，而且现发酵的的菌液数量多活性好 。那么在选择EM菌菌中的时候大家要关注菌种的好坏 。一般而言，判断菌种好坏有一个最简单的指标pH值 。因为EM菌种的乳酸菌含量最多，EM菌菌液的pH值较低说明乳酸菌含量丰富，也就意味着整体的EM菌活性较高 。一般而言pH值在3.5以下就算是好菌种 ， 如果可以达到3以下就算是质量特别好的EM菌种了 。
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