科普 | 奥密克戎的身世之谜 _生活百科-「四川龙网」

1、奥密克戎怎么就火了呢？
WHO将最新的B.1.1.529新冠病毒变种命名为Omicron（奥密克戎），并列为5种“密切关注变种”之一。
11月24日，南非卫生部门首次向世界卫生组织(WHO)报告发现的新冠病毒变种B.1.1.529，并引起了社会极大的关注。实际上，B.1.1.529变种首先是在11月9日在南非邻国的博茨瓦纳共和国发现的，并迅速在南非扩散，11月以来，B.1.1.529变种在南非流行比率已经上升至75%，几乎取代了正在全球流行中占主导地位的德尔塔变种。这一现象即刻引起WHO关注，加上B.1.1.529变种的病毒S蛋白含有目前发现最多的突变位点(32-35个突变位点)，WHO于2021年11月26日将其列为第5种“密切关注突变体”（VOC），以希腊字母命名法命名为Omicron（奥密克戎）变种，与已经存在的前4种主要变种：英国发现的Alpha（B.1.1.7）；南非发现的Beta (B.1.351)；巴西发现的Gamma (P.1)；以及印度发现的Delta (B.1.617.2)列为相同关注等级。截止到目前，Omicron已在中国香港、英国、德国、意大利、比利时、以色列等多个国家和地区检出。全球多国由于该新突变株的出现收紧了防控措施。

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图1：WHO组织定义的5种密切关注的新冠病毒突变株（VOC）。
2、奥密克戎的全球流行走向仍然未知
【科普 | 奥密克戎的身世之谜】目前为止，共有5种变种被列为“密切关注突变体”VOC, 分别是Alpha，Beta，Gamma, Delta和最新的Omicron 。其中Alpha在2020年10月到2021年6月作为主要毒株在全球流行，随后，Delta逐渐代替Alpha成为优势毒株。在Alpha和Delta的焦灼激战过程中，在南非出现的Beta和巴西出现Gamma由于显著的免疫逃逸能力，也被列为VOC，但Beta和Gamma在全球范围内的流行数目远小于Alpha和Delta 。在南非报道Omicron病例的两天后，Omicron的全球流行数目还未知的情况下，11月26日WHO即将Omicron列为VOC，可见其对Omicron在南非传播比例迅速上升势头的高度重视。
3、奥密克戎的突变最多，突变都在哪里，可能有什么影响呢？
新冠S蛋白（刺突蛋白）是负责病毒入侵宿主细胞的蛋白，S蛋白通过与细胞上的受体ACE2结合进入细胞。现有疫苗的主要成分也是S蛋白，通过诱导针对S蛋白的抗体来阻止病毒进入细胞。因此，S蛋白上的突变直接影响了病毒进入细胞的效率以及疫苗诱导的抗体能否有效阻止病毒。
S蛋白在结构上分为两部分，S1区和S2区。S1又分为4个小的结构域：N端结构域(NTD)，受体结合结构域(RBD), 以及亚结构域1和2(SD1,SD2) 。其中RBD负责与受体ACE2结合，而NTD负责在RBD结合受体时起稳定作用。S2区主要包括7肽重复序列1和2(HR1, HR2), 这两个结构域负责受体结合后拉近病毒膜与细胞膜的距离，促进膜融合以完成入侵过程。
目前公布的突变体序列表明奥密克戎在S蛋白上有33个左右的点突变，其中S1上有27个突变（NTD 7个，RBD 15个，SD1和SD2 上共5个），还有6个突变发生在S2结构域上（图2）。由于15个突变集中在RBD区，因此有怀疑如此大量的突变会使得新冠病毒“脱胎换骨”，可能会突破现有的疫苗防线。
但实际情况是，其中大部分突变并不是凭空出现的，在已经存在的突变株中出现过。这33个突变都在以前的毒株中以单点突变的形式出现过，其中8个突变在VOC株里出现过，如del69-70，del144曾出现在Alpha中，K417N, N501Y曾出现在Beta和Gamma中，T478K曾出现在Delta中，而484位的突变也持续出现在Beta, Gamma, Eta, Kappa等突变株中。

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